All'ufficio è assegnato il compito di provvedere al ricevimento ed alla registrazione della corrispondenza in arrivo, comprese le PEC (mediante classificazione in categorie, classi e fascicoli) e all'assegnazione di tali documenti ai servizi competenti.
La procedura viene realizzata con l'ausilio di un programma informatico. L'ufficio si occupa anche della spedizione della posta in partenza e delle ricerche nell'archivio di deposito comunale.
Il cittadino può rivolgersi inoltre al Protocollo per il ritiro di "atti giudiziari".
All'Ufficio Protocollo sono depositati gli atti dell'Ufficiale Giudiziario (raccomandata busta verde Atti Giudiziari). Per il ritiro presentarsi, previo appuntamento, con la busta della raccomandata ed un documento di riconoscimento. È possibile il ritiro di atti di altre persone con delega e copia del documento di identità del delegante